校徽：图案为圆形，以白色为基调，象征着医药的圣洁高雅及人道主义的历史使命。双环中的外环寓意地球，内环寓意校园，象征着黑龙江中医药大学面向现代化、面向世界、面向未来。

六边形轮廓形似雪花又如苯环结构，代表着学校所处的地域，并体现着学校内涵的现代化；六边形的绿色象征自然、象征着人们对生命的尊重和人文主义精神，具有历史的深邃感，体现着黑龙江中医药大学做精中医、做强药学、做大学校的发展方略，更体现祖国医药学的博大精深。

中医药汉语拼音字头以黄白两色组合的Z与YY，代表着黑龙江中医药大学以中医药学科为主体，医药结合，多学科协调发展，建设特色突出、国际上有一定影响、中国国内一流的高水平中医药大学的目标。其中黄色的Z表现出一种朝气和辉煌，象征着五千年的中华文化和中医药在传承中华文化过程中的使命。YY酷似两个携手并肩的人，象征中医药人团结协作；又如破土而出的嫩芽，寓意着中医药事业充满着生机和活力。

校旗由白、绿（青）、黑、红、黄五种颜色组成，分别对应中医金、木、水、火、土五行，表明学校以发展中医药事业为核心目标的基本定位。其中，底部的黄色代表土，象征大地，寓意中医药植根于中华民族五千年灿烂文明的土壤中，象征中医药高等教育深厚的历史和人文底蕴；中间的绿（青）色代表木，象征自然、象征生命，寓意中医药学科的自然属性和中医药人救死扶伤的神圣使命，也象征莘莘中医药学子，寓意学校“立德树人”的办学方向和价值追求；黑色代表水，黑色校名写在绿色底色上，象征学校质朴厚重的文化传统，也寓意学校育人如春风化雨般润物无声，潜移默化哺育中医药学子成长；上方的白色代表金，象征着该校师生从事的中医药事业的圣洁及人道主义精神，同时也象征高远的天空，象征学校开放式办学的视野和思路，寓意中医药高等教育面向世界、面向未来；红色代表火，红色反白校徽象征太阳，寓意中医药人对中医药事业永恒的追求和不竭的热情，象征全校师生在大学精神指引下，为实现高水平中医药大学的奋斗目标而团结一心、锐意进取。整体构图同时传达出一种寓意：在朗朗晴空、阳光普照、雨露滋养之下，大地上万物生长，生生不息；莘莘中医药学子在大学精神和理想信念指引下，在中医药深厚的文化积淀和根基之上，在师长的带领下，在学校良好的教学环境中成长、成才，共同开创中医药事业的光明未来。

徽标以数字60作为基本创意思路，其中融入了阴阳、五行、中药、火焰、腾飞、翔云、灵芝等设计元素，鲜明的彰显出黑龙江中医药大学60年校庆主题及办学特色。

徽标60运用了书法中的飞白进行艺术处理，构图苍劲又不失灵动，体现出中医药大学未来前程似锦，行云流水，反应出学校朝气蓬勃及开拓创新的时代精神。

数字6运用了阴阳太极图进行了极为巧妙的融和，不仅体现出中医之精髓，同时又代表着历史车轮，传达出黑龙江中医药大学勇往直前追求梦想的精神。

数字0运用了翔云及中草药灵芝进行创意，翔云代表祥和，同时也激起学子对美好未来的憧憬，寓意海阔凭鱼跃、天高任鸟飞。

颜色红黄绿蓝黑白六色作为基本色调，六种色彩寓意着中医五行。其中红色代表太阳圣火，黄色代表大地生机，绿色代表生态自然，蓝色代表天空宁静，黑色代表扎实厚重，白色代表纯洁清亮。绚丽耀艳的色彩立体的呈现出黑龙江中医药大学60年发展的辉煌历程，同时也寄托着人们对黑龙江中医药大学美好未来的向往与诚挚的祝福。