中山大学新华学院院徽沿用了中山大学校徽的圆型、钟楼、海棠式洞窗、木棉花等基本元素。另一方面，中山大学新华学院院徽则添加了一些象征青春活力，显现团结奋进的元素。原有中山大学校徽钟楼两侧的茂盛树形，也巧合并寓意山峰之形，同时也蕴藏着中山大学新华学院师生一方面要保持母体学校精心育人和百年树人的精神；又体现具有开拓创新和勇攀高峰的信心和勇气的寓意，以体现传承与创新。

图形的中心，木棉花型之内，上方保留原有中山大学校徽的钟楼图形，中部配以中山大学新华学院建院之初的院门，并书院名“中山大学新华学院”八个字，院门下方八根大柱矗立，寓意学院注意强化学生的思想、品德、知识、素质、思维、能力、身心、技能的培养训练，同时也衬托出门前的康庄大道，寓意学生的成长成才之路。

原有中山大学校徽木棉花型下方所书“1924”建校年份，在中山大学新华学院院徽中改为“2005”的建院年份，它表示中山大学新华学院作为中山大学在经历八十周年的光辉历程之后绽放出的新花。表明中山大学新华学院师生将继承中山先生遗志，传承中山大学优良传统，锐意进取，继往开来，阔步前进，争创辉煌。