设计理念:旗面由三个平行且相等的横长方形组成,上侧居中标注着“中国科学院大学”的中英文名称和校徽,下侧是“工程科学学院”院徽和班级名称,中侧是一个展开双翅,预待飞翔的天使翅膀,祝愿工学院20209003班的同学们在奔向前程的路上越飞越高。翅膀中间是由阿拉伯数字和英文融合在一块儿的班级代号,班级口号“无可替代 青春澎湃 永不言败”环绕在上半圆上,其上是一顶皇冠,表示“欲戴皇冠,必承其重”,激励同学们在最好的青春年华奋发向上。班旗整体背景为浅蓝天空,展现“海阔凭鱼跃,天高任鸟飞”的设计理念,希望大家珍惜伟大时代,珍惜学校和国家提供给我们的广阔天地,用青春之我谱写青春之歌!